中共福建省纪律检查工作委员会省直机关工作委员会是省纪委的派出机构，同时挂“省监察厅派驻省直机关行政监督专员办公室”牌子，为副厅级。主要职责是：领导省直各机关党组织的纪律检查工作，研究、制定省直机关党风廉政建设和反腐败斗争的措施和办法；查处省直机关党员干部的重大违纪案件，审议有关党员领导干部的党纪处分，审批省直机关处级党员干部“撤销党内职务”及以上的党纪处分；指导省直机关加强案件查处工作。同时受省监察厅的委托，组织协调省直机关行政监察工作的有关事项，对省监察厅负责并报告工作。
根据工作需要，省直纪工委内设办公室、案件检查室、案件审理室（均为副处级）。