2004年2月，省直团工委被共青团中央、全国绿化委员会、全国人大环境与资源保护委员会、全国政协人口资源环境委员会、水利部、农业部、国家环保总局、国家林业部等八家单位评为2003年度“全国保护母亲河行动先进集体”。

2004年11月，省直团工委被共青团福建省委评为2004年度“福建省共青团信息工作先进单位”。

2004年12月，省直团工委被共青团中央、农业部评为2004年度“服务农村青年增收成才先进集体”荣誉称号。

2005年4月，省直团工委被共青团福建省委评为“全省共青团城乡互动百千万工程活动优秀组织奖”

2005年12月，省直团工委组织省直代表队参加“永远跟党走  作为在海西”全省党团知识竞赛，荣获一等奖。

2005年，省直团工委副书记陈宜淳同志被共青团中央评为“全国优秀共青团干部”。

2006年5月，省直团工委被共青团福建省委授予“福建省增强共青团员意识主题教育活动组织奖”